Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms