Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms