Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF4Q2M2E3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms