Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms