Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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