Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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GEN1Q17RS7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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GEN1Q17RS7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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GEN1Q17RS7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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GEN1Q17RS7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GEN1Q17RS7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GEN1Q17RS7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GEN1Q17RS7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GEN1Q17RS7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GEN1Q17RS7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GEN1Q17RS7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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