Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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NDUFA9Q16795 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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NDUFA9Q16795 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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NDUFA9Q16795 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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