Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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