Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SGCBQ16585 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SGCBQ16585 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SGCBQ16585 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SGCBQ16585 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SGCBQ16585 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SGCBQ16585 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SGCBQ16585 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SGCBQ16585 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SGCBQ16585 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SGCBQ16585 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SGCBQ16585 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SGCBQ16585 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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SGCBQ16585 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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SGCBQ16585 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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