Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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RPE65Q16518 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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RPE65Q16518 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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