Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA6Q16445 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms