Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms