Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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