Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA2Q15822 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms