Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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