Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPEGQ15772 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms