Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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EFNB3Q15768 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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EFNB3Q15768 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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EFNB3Q15768 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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EFNB3Q15768 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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EFNB3Q15768 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB3Q15768 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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