Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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CYTH1Q15438 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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CYTH1Q15438 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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CYTH1Q15438 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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CYTH1Q15438 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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CYTH1Q15438 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYTH1Q15438 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms