Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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IRF4Q15306 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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IRF4Q15306 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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IRF4Q15306 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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IRF4Q15306 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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IRF4Q15306 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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IRF4Q15306 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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IRF4Q15306 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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IRF4Q15306 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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IRF4Q15306 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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IRF4Q15306 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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IRF4Q15306 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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IRF4Q15306 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF4Q15306 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF4Q15306 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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