Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHPRHQ149N8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
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