Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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GBX1Q14549 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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GBX1Q14549 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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GBX1Q14549 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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GBX1Q14549 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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GBX1Q14549 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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GBX1Q14549 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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GBX1Q14549 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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