Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
COL4A6Q14031 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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COL4A6Q14031 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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COL4A6Q14031 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL4A6Q14031 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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