Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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