Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms