Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
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