Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NR5A1Q13285 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms