Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms