Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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