Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms