Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms