Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMAN2Q12907 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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