Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms