Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4BQ07343 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms