Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms