Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms