Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms