Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PLCB3Q01970 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLCB3Q01970 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms