Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPP2R2BQ00005 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms