Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2A1P68400 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2A1P68400 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms