Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UFM1P61960 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UFM1P61960 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms