Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms