Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAV3P56539 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAV3P56539 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAV3P56539 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAV3P56539 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAV3P56539 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAV3P56539 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAV3P56539 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms