Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BGRP55822 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms