Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA1P52907 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms