Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms