Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRP9P49458 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms