Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC1A1P43005 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A1P43005 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms