Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKARP32238 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCKARP32238 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKARP32238 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms