Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD1CP29017 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD1CP29017 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD1CP29017 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms