Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAP3P28838 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAP3P28838 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAP3P28838 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms